La Asociación Nacional de Instituciones de Docencia e Investigación Económica (ANIDIE), cuenta con una mesa directiva integrada por un Presidente, Secretario Técnico, Secretario Académico, Secretario de Planeación y Evaluación, Secretario de Investigación, Secretario de Difusión y Publicaciones, Secretario de Finanzas, Secretario de Vinculación y un Secretario de Acreditación y Certificación.

Además de contar con Coordinadores por Regiones, dividiendo a la República Mexicana de la siguiente forma:

• Región Noroeste: Baja California, Baja Clifronia Sur, Durango, Sonora y Sinaloa.
• Región Norte: Nuevo León, Coahuila, Chihuahua y Tamaulipas.
• Región Occidente: Nayarit, Jalisco, Colima y Michoacán.
• Región Centro: Hidalgo, Puebla, Morelos y Tlaxcala.
• Región Centro Bajío: Guanajuato, San Luis Potosí, Aguascalientes, Zacatecas y Querétaro.
• Región Sur: Verazcruz, Oaxaca, Guerrero y Chiapas.
• Región Sureste: Campeche, Quintana Roo, Yucatán y Tabasco.
• Area Metropolitana del D.F. y Estado de México, No. 1: Universidad Autónoma Metropolitana (UAM) Unidad Xochimilco, Universidad Autónoma del Estado de México (UAEMEX) Unidad Toluca, C.U., Centro Universitario México División Estudios Superiores, A.C. CUM, Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey (ITESM), campus Toluca.
• Area Metropolitana del D.F. y Estado de México, No 2: Centro de Estudios Económicos Colegio de México, Centro de Investigación y Docencia Económicas, A.C. (CIDE), Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) Escuela Nacional de Estudios Profesionales Acatlán Aragón, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) Santa Cruz Acatlán, Universidad Latina, S.C. Campus Sur, Universidad Panamericana (UP) Azcapotzalco, Universidad Tecnológica de México. Unitec Campus Marina, Universidad Tecnológica de México. Unitec Campus Sur, Universidad Anáhuac, Universidad Nuevo Mundo, A.C. Campus San Mateo, Universidad Tecnológica de México. Unitec Campus Atizapan.
• Area Metropolitana del D.F. y Estado de México, No 3: Escuela Bancaria y Comercial, S.C., Plantel Reforma. Instituto Tecnológico Autónomo de México (ITAM), Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores De Monterrey (ITESM) Campus Ciudad de México, Universidad Anáhuac del Sur, A.C., Universidad del Valle de México (UVM) Campus San Rafael, Universidad Iberoamericana (UIA) Plantel Santa Fé, Universidad del Valle de México (UVM) Campus Lomas Verdes.